國家對加工貿易政策作重大調整，對深圳市現有加工貿易生產體系產生了較大影響。據深圳市貿工局測算，2006年深圳市加工貿易出口新增限制類商品25.9億美元，占全市加工貿易出口的2.8%。其中，出口居前的產品主要有塑料及其制品15.9億美元、木制家具3.4億美元、棉紗及棉布0.9億美元。涉及新增限制類目錄產品的加工貿易企業3000多家。此次加工貿易政策調整后，深圳市相關加工貿易企業將面臨大量臺賬保證金壓力、企業競爭力削弱以及招商引資工作難以開展等方面的問題。